http://www.geocities.jp/meir000/ck/index.html

どうもckじゃないとだめなんだよな。
ということで、cygwinを1.7.1に上げたらckが動かなくなったのだけど
探したら心優しい方がパッチを当ててくれたようです。万歳。

今さらですが1.7はファイル周りなどが改善されていてお勧めです。
What's new and what changed in Cygwin 1.7