単純で一直線に安定化に向かうダウンヒルフォールディングのみならず、多状態フォールディングなどがあるらしい。
そしてそもそもフォールディングせず機能するタンパク質、フォールディングに失敗して分解されてしまうタンパク質などもあるらしい。

シャペロン
https://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%B7%E3%83%A3%E3%83%9A%E3%83%AD%E3%83%B3
フォールディングの手助けをするタンパク質。フォールディングの成功率や時間短縮のため、手助けが必要らしい。

天然変性タンパク質
http://www.biophys.jp/dl/journal/49-1.pdf
フォールディングしないタンパク質。
フォールディングしていないにも関わらず、分解もされない。役割も一部は転写因子として機能していることは分かっているが、殆ど分かっていない。
真核生物にしか存在していないらしく、さらに真核生物のタンパク質の1/3は変性であるという。となれば、相当重要な役割を担っているはずだが、あまり研究が盛んではない分野らしい。どう考えても面白そうなのに何故ですかね。

細胞の中で、人間社会の工場と同じようなタンパク質の品質管理が行われているらしい。ざっくり以下の様な工程。

• 不良品が発見されたらラインを止める
  • 良不良の判定、それに基づいた翻訳の停止
• 修復できるものは修復する
• 不良品が多過ぎたら工場の外で廃棄処分
  • 不良品はリソソームにてアミノ酸に分解
• どうしても不良品の生産が続くなら工場自体の閉鎖
  • 不良品のタンパク質しか作れなくなったら自殺(アポトーシス)

細胞とは、分子機械(ナノマシン)の設計図(核)とそれを生産する工場そのものなんですね。そして、設計図と工場自体が自己複製できる系であり、それが生命の定義である、と。
あと、いろいろ書いてあるけど、そういった仕組みがあることは分かっても、具体的にどうやっているのかはまだ謎が多いっぽい。

核から出てきたmRNAは リボソーム にて翻訳されタンパク質が合成される。 小胞体 でタンパク質のフォールディングや切断・結合・糖鎖の修飾が行われ、次に ゴルジ体 でもさらに糖鎖や脂質などの修飾が行われる。その後、タンパク質は目的地へと運ばれる。不思議なのは、その輸送システム。

それぞれのタンパク質は小胞と呼ばれるものに包まれ、各々の目的地へと輸送されるらしい。ではタンパク質がペイロードだとすれば、目的地を示すヘッダーの情報はどこにあるのか？その情報を読み取って判別する仕組みは？目的地へと物理的に移動させる仕組みは？小胞を作る仕組みは？小胞を受け取る仕組みは？
輸送システム含め、膜システムがあまりに良く出来過ぎてて怖いですね。

小胞
https://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%B0%8F%E8%83%9E

小胞輸送
https://bsd.neuroinf.jp/wiki/%E5%B0%8F%E8%83%9E%E8%BC%B8%E9%80%81

第３回 細胞膜の構造と膜輸送
http://www.cc.okayama-u.ac.jp/~hirofun/2011cb03.pdf